LILITH出芽說
這篇文章討論以Q&A的形式，探討LILITH下半身之謎。
問題一：為何Lilith在作品前部份沒有朗基奴斯槍插入時不長出下半身？
首先，這是一個假設的問題，因為在動畫中我們從未看過Lilith在沒有長槍插入時的模樣。這樣作假設是因為在南極帶回長槍之前，最終教條裏的Lilith應該是沒有被插上的，那會是什麼模樣？正常想的話應該是沒有下半身吧！(而在漫畫中的確是沒有的)
先要說說有關AT力場的理論，據薰說：AT力場是心之壁
有心(魂)的話就能展開AT力場，加上LCL在最低限度能保持其形態(當然要加上有活下去的意志)，如使徒一類就是更能玩弄AT力場於股掌之間，但亦因為 AT力場之強大，使徒也只能寂寞地生存(AT力場亦是人與人之間的牆壁，動畫中也曾分析過使徒似是沒有組織的行動著)
LILITH沒有下半身很可能是因為在製作初號機及零的複製時用去了，但此下半身並沒有長出。這很可能是因為LILITH沒有魂的原故。
之前說過，魂是展開AT力場的成因之一，因而擁有形態及力量。LILITH因為有魂而組成了其身體。這可以在劇場版中看見，在零回到LILITH的時候，也就是回魂之時。LILITH即可以控制自己的形態，她能令自己的手穿過那兩口釘，令到下半身的人腳收回，也能變成零的身形。因此，可以推論，在老碇奪走其下半身時，LILITH失去了其魂，不能再展開AT力場，因此下半身長不出來。
問題二：跟據以上的推論，無魂的LILITH為何沒有變成LCL？
我們在補完中可見，人們失去AT力場，變成了LCL。而然無魂的LILITH卻沒有變成LCL呀！可能：
那是LILITH，不是我們這種人類，因此不可以比較
魂不完整，或許有大部的魂留在零裏，只有小部分留在LILITH身上，就如在京子身上那殘缺不全的魂
此兩種推論，(1)沒甚證明，(2)如果成立的話或許能解釋，但魂可以分成很多部份的嗎？那魂豈不是可以量化？可以用科學計算出來？大家能接受嗎？(至於京子，我會解釋為因為實驗失敗而強行將魂撕開了) 以下是我個人較接受的說法：
- 人類死的時候，也就是「魂歸天國」之時(或許該說靈魂之屋)，但我們在動畫看到人類死的時候，他們失去靈魂會變成LCL嗎？不會。那沒有魂的時候AT力場不是失去了嗎？
想清楚，我只是說有魂就能展開AT力場，沒有說沒魂的時候AT力場會消失。在劇場版中，因為人們給反AT力場所侵/中和，所以失去AT力場。
問題三：那為何在拔出朗基努斯槍之後，LILITH又長出下半身呢？
我們將LILITH分析成兩部份：生物性及精神領域，生物性就是指一個生物應有的動物行為，以人為例，就如吃、喝、睡等，而精神領域就是指「魂」的一類東西。
然而，LILITH的生物性為何？不知道，但她重生的力量應是其生物性之一(細胞分裂)。LILITH是雌雄同體的(補完時LILITH可變成薰及零)，其繁殖方法是用出芽的方法，做出複製體的人類，灌以靈魂之後就幻化成自己的獨有形態。(相信人類組先是這麼做出來吧！)因此，LILITH的生物本能應當有細胞分裂，即重生。
在有魂的時候，我們看到LILITH的細胞分裂能力是相當強，能隨意變形，還可以變大。(劇場版中，LILITH開始時比GEOFRONT還小，在最後竟長至GEOFRONT只是其手掌上的小球。)但在沒有魂的時候，其細胞分裂力大大減弱，在沒有長槍的情況也長不出什麼來。
之後，長槍插在LILITH生上，在某程度上限制了她的生長似的。我們在這裏假設，其實長槍沒有抑制LILITH的生長，在其體內，細胞分裂仍然繼續，只是因為長槍限制了，而不能表露於外。(肉體硬化？)在拔出長槍之後，其已分裂的細胞就如洪水般洶湧而出。亦因為這只是細胞分裂的生物動作，其下半身的人腳並沒有得到補完而繼續表露於外。
然而此說法是有漏洞的，就是時間上的問題。記得長槍是在2015-16年才收回的吧，那LILITH給插的時候直到長槍拔出時還不到一年，為什麼一年的細胞分裂就那麼利害？那之前從LILITH沒有魂的時候(即零出現的時候)，直到2015年，最小也有十多年吧，為麼連一個下半身也長不了？
可能的解譯是：NERV的人一直為了摸擬系統(DUMMY PLUG SYSTEM)而不斷從LILITH身上取去其物質，複製成那一大缸的綾波零的空殼，這是碇源堂的計劃。
補充：LILITH肉身的穿透性
在EOE中，我們可以看到LILITH不斷擴大，而且穿過建築物到達初號機所在的站置。
的而且確, LILITH在穿過建築物時幾乎都沒有肉體可言。但在零跟LILITH結合的那一幕,那種「橡膠式」的肉體表現實在不能忽視。
究竟同化是否等於肉體化？ LILITH的生物性是否還有其他？如可以隨意控制身體物質的組合，做成可以穿過實物？
還可以這樣想，是否有能量跟質量在轉換E=MC^2？ 化成能量, 就能穿越建築物。